Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX6Q13608 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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