Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA3FQ13275 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA3FQ13275 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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