Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GRIN2BQ13224 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN2BQ13224 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
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