Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NR1H3Q13133 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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