Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RESTQ13127 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RESTQ13127 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RESTQ13127 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RESTQ13127 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RESTQ13127 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RESTQ13127 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RESTQ13127 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RESTQ13127 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RESTQ13127 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RESTQ13127 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RESTQ13127 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RESTQ13127 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RESTQ13127 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RESTQ13127 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms