Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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TRAF3Q13114 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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TRAF3Q13114 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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TRAF3Q13114 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF3Q13114 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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