Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BNIP1Q12981 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNIP1Q12981 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms