Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPRL3Q12980 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms