Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD4Q12950 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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