Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRJQ12913 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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PTPRJQ12913 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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PTPRJQ12913 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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PTPRJQ12913 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRJQ12913 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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