Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIAQ12857 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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