Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TROQ12816 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TROQ12816 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TROQ12816 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
TROQ12816 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
TROQ12816 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
TROQ12816 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
TROQ12816 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
TROQ12816 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
TROQ12816 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TROQ12816 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TROQ12816 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TROQ12816 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TROQ12816 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TROQ12816 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TROQ12816 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TROQ12816 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TROQ12816 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TROQ12816 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TROQ12816 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TROQ12816 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TROQ12816 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TROQ12816 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TROQ12816 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TROQ12816 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
TROQ12816 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TROQ12816 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TROQ12816 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TROQ12816 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TROQ12816 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TROQ12816 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TROQ12816 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TROQ12816 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TROQ12816 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TROQ12816 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TROQ12816 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TROQ12816 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TROQ12816 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
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