Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SYCNQ0VAF6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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