Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIPPLY1Q0D2K3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms