Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP4Q09028 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms