Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms