Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX4Q06945 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOX4Q06945 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOX4Q06945 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SOX4Q06945 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SOX4Q06945 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SOX4Q06945 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOX4Q06945 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX4Q06945 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX4Q06945 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX4Q06945 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX4Q06945 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms