Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms