Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CALD1Q05682 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms