Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms