Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ID3Q02535 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ID3Q02535 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms