Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XPCQ01831 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XPCQ01831 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPCQ01831 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
XPCQ01831 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
XPCQ01831 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPCQ01831 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XPCQ01831 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XPCQ01831 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPCQ01831 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XPCQ01831 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPCQ01831 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPCQ01831 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms