Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC10Q01780 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC10Q01780 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms