Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD83Q01151 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD83Q01151 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD83Q01151 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD83Q01151 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms