Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms