Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZBED6P86452 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED6P86452 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms