Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRB1P82279 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRB1P82279 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CRB1P82279 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CRB1P82279 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CRB1P82279 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CRB1P82279 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CRB1P82279 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRB1P82279 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRB1P82279 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRB1P82279 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRB1P82279 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRB1P82279 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRB1P82279 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRB1P82279 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CRB1P82279 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CRB1P82279 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRB1P82279 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRB1P82279 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CRB1P82279 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRB1P82279 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms