Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACTA1P68133 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms