Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPS25P62851 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS25P62851 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS25P62851 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS25P62851 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPS25P62851 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPS25P62851 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS25P62851 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS25P62851 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS25P62851 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms