Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P61574 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms