Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3BP58499 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms