Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIK1P57059 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIK1P57059 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIK1P57059 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIK1P57059 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIK1P57059 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK1P57059 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK1P57059 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK1P57059 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK1P57059 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK1P57059 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK1P57059 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK1P57059 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK1P57059 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK1P57059 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK1P57059 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIK1P57059 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIK1P57059 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIK1P57059 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIK1P57059 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIK1P57059 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK1P57059 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms