Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2BFSP57053 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2BFSP57053 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms