Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX10P56693 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX10P56693 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX10P56693 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX10P56693 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX10P56693 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX10P56693 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX10P56693 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX10P56693 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms