Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUCLG1P53597 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms