Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LBX1P52954 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LBX1P52954 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LBX1P52954 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LBX1P52954 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LBX1P52954 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LBX1P52954 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LBX1P52954 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LBX1P52954 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms