Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RGS4P49798 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RGS4P49798 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RGS4P49798 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RGS4P49798 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RGS4P49798 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RGS4P49798 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RGS4P49798 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RGS4P49798 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RGS4P49798 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RGS4P49798 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RGS4P49798 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RGS4P49798 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RGS4P49798 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RGS4P49798 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RGS4P49798 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RGS4P49798 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RGS4P49798 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RGS4P49798 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RGS4P49798 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RGS4P49798 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms