Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK2P49760 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK2P49760 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK2P49760 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK2P49760 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK2P49760 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLK2P49760 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLK2P49760 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK2P49760 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms