Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TTPAP49638 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TTPAP49638 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TTPAP49638 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TTPAP49638 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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