Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TM4SF4P48230 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms