Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALR1P47211 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALR1P47211 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALR1P47211 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALR1P47211 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALR1P47211 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GALR1P47211 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GALR1P47211 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GALR1P47211 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GALR1P47211 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GALR1P47211 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GALR1P47211 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GALR1P47211 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GALR1P47211 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GALR1P47211 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GALR1P47211 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GALR1P47211 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GALR1P47211 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms