Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP5P45974 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP5P45974 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP5P45974 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP5P45974 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP5P45974 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP5P45974 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP5P45974 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP5P45974 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms