Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF9P41273 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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