Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDH1P40925 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDH1P40925 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDH1P40925 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDH1P40925 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDH1P40925 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDH1P40925 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDH1P40925 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
MDH1P40925 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDH1P40925 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDH1P40925 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms