Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGAEP38570 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGAEP38570 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms