Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GGCXP38435 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GGCXP38435 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GGCXP38435 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GGCXP38435 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GGCXP38435 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GGCXP38435 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GGCXP38435 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GGCXP38435 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GGCXP38435 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms