Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms