Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUP214P35658 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP214P35658 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP214P35658 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP214P35658 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP214P35658 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP214P35658 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP214P35658 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP214P35658 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP214P35658 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP214P35658 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP214P35658 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUP214P35658 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms