Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RBL1P28749 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBL1P28749 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBL1P28749 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBL1P28749 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
RBL1P28749 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBL1P28749 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBL1P28749 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RBL1P28749 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RBL1P28749 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RBL1P28749 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RBL1P28749 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RBL1P28749 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms