Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERCC5P28715 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms